Hello,
I’d like to analyse the homogeneity of the voxel values along the x, y and z axis.
Is there any way of getting the mean voxel value of an area along an axis.
Like for each slice the same area → calculating the voxel value mean of that are → Plotting voxel value over the depth of the slice [mm].
I hope you understand what i mean and can help me out.
#x 122 bis 153 (31 Pixel)
#y 71 bis 107 (36 pixel)
#Slices 140 bis 800 (660)
n=getNode(“NodeName”)
nD=n.GetDisplayNode()
a=array(“NodeName”)
mid =
z = 0
sum = 0
h=0
for s in range(140, 802): #662 Slices 140 bis einschließlich 801
for y in range(71, 108): #37 Pixel 71 bis 107 fließt ein
for x in range(122, 154): #32 Pixel 122 bis 153 fließt ein
if z < 1184:
sum = sum + a[s,y,x]
z = z + 1
else:
m = sum / z
mid.append(m)
sum = 0
z = 0
sum = sum + a[s,y,x]
z = z + 1
m=sum/z
mid.append(m)
import numpy as np
np.savetxt(“DateiName.csv”, mid, delimiter=‘,’) # zum Exportieren
#Bereich in x Richtung
n=getNode(“NodeName”)
nD=n.GetDisplayNode()
a=array(“NodeName”)
mid =
z = 0
sum = 0
h=0
for x in range(56, 325): # 269 Pixel 56 bis 324 fließt ein
for s in range(40, 891): # 851 Slices 40 bis einschließlich 890
for y in range(214, 244): # 32 Pixel 123 bis 155 fließt ein
if z < 25530:
sum = sum + a[s,y,x]
z = z + 1
else:
m = sum / z
mid.append(m)
sum = 0
z = 0
sum = sum + a[s,y,x]
z = z + 1
m=sum/z
mid.append(m)
import numpy as np
np.savetxt(“DateiName.csv”, mid, delimiter=‘,’) # zum Exportieren