(automatically translated using Google translate)
I am using confocal microscope images. I need to segment some parts of an ant’s head. For example, the eyes. First, I painted three layers (one at the beginning, when the eyes started to show, one in the middle, where the eyes look bigger, and one at the end, where they look smaller again.
Second, once I have painted three layers, I used the Fill Between slices effect > set the Editable Intensity range to 130.00 > clicked on Initialize > Show 3D. After this, I again adjust the Editable Intensity range to 255.00 and click Apply.
Use these adjustments on the range and I got a pretty nice segment. However, I’m not sure if adjusting the range twice can affect the volume.
That is why my question is: Using these steps already mentioned, is the volume you obtain viable? That is, can I trust it? or can it lead to margins of error in the volume calculation. When I talk about volume, I mean the result when I apply Segment Statitics and it gives me a volume in mm3 and cm3.
This is how the segment looks for me applying the adjustments that I mention in the second paragraph.
Original in Spanish
Estoy utlizando imagenes de microscopio confocal. Necesito segmentar algunas partes de la cabeza de una hormiga. Por ejemplo, los ojos. Primero, pinte tres capas (una al inicio, cuando empezaban a verse los ojos, una en el medio, donde los ojos se ven mas grandes y una al final, donde se ven mas pequenos nuevamente.
Segundo, una vez he pintando tres capas, utilice el efecto Fill Between slices > ajuste el rango de Editable Intensity range a 130.00 > hice click en Initialize > Show 3D. Posterior a esto, nuevamente ajusto el rango de Editable Intensity range a 255.00 y hago click en Apply.
Utilice estos ajustes en el rango y obtuve un segmento bastante bonito. Sin embargo, no estoy segura si ajustar el rango dos veces pueda afectar el volumen.
Es por ello que mi pregunta es: Utilizando estos pasos ya mencionados, el volumen que obtenga es viable? Es decir, puedo confiar en ello? o puede dar lugar a margenes de error en el calculo de volumen. Cuando hablo de volumen, me refiero al resultado de cuando aplico Segment Statitics y me da un volumen en mm3 y cm3.
Asi me queda el segmento aplicando los ajustes que menciono en el segundo parrafo.
